More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl082 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 76 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  87.5 
 
 		 75 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  73.53 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 77 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 77 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 77 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 77 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 77 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 77 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 77 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 77 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 77 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 77 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 77 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  73.44 
 
 		 78 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  65.67 
 
 		 79 aa  98.2  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  70.31 
 
 		 80 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  64.86 
 
 		 77 aa  96.7  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  68.75 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  68.75 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  65.62 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  64.62 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  64.62 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 		 76 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 		 76 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 75 aa  91.3  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  60.61 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  62.69 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 78 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 75 aa  87.4  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  57.53 
 
 		 75 aa  87.4  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  57.75 
 
 		 74 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 78 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 80 aa  87  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 80 aa  87  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  56.92 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  60.87 
 
 		 88 aa  84.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  53.62 
 
 		 74 aa  84.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 74 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 90 aa  83.6  7e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  67.8 
 
 		 76 aa  84  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 76 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  48.65 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  55.71 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  64.41 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  47.3 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  69.64 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0331  30S ribosomal protein S18  55.93 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1218  SSU ribosomal protein S18P  57.58 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  54.67 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  55.71 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  55.93 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  55.93 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  56.92 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  55.71 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0604  ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  59.02 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>