More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3772 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 91 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  68.18 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  63.16 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  69.51 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  64.29 
 
 		 74 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  68.57 
 
 		 80 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  68.57 
 
 		 80 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  67.69 
 
 		 76 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  70.77 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 		 75 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 92 aa  97.4  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  69.7 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  63.08 
 
 		 76 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 76 aa  96.7  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  64.62 
 
 		 75 aa  96.7  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  63.01 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  63.08 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  61.04 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  61.04 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  55.68 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  67.74 
 
 		 74 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  55.68 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  67.19 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  58.97 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  52.75 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  62.67 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  62.67 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  68.75 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  63.08 
 
 		 76 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  65.67 
 
 		 77 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  65.67 
 
 		 77 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  65.67 
 
 		 77 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  56.63 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  65.67 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  55.68 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  65.67 
 
 		 77 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  62.32 
 
 		 78 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1086  30S ribosomal protein S18  62.32 
 
 		 73 aa  90.5  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000857615  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  63.08 
 
 		 81 aa  90.5  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0928  30S ribosomal protein S18  62.32 
 
 		 73 aa  90.5  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0375041  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 70 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 79 aa  90.1  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  65.62 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  62.9 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  55.7 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  64.62 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  65.15 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 80 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 80 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  56.58 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  60.27 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  54.79 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 75 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 85 aa  84  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 74 aa  84.3  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 76 aa  83.6  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  51.16 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 74 aa  83.6  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00745  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2132  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157171  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2051  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.255921  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5661  30S ribosomal protein S18  69.81 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1211  SSU ribosomal protein S18P  50.59 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114712  normal  0.854081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65170  30S ribosomal protein S18  69.81 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  56.58 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>