More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2095 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  100 
 
 
92 aa  189  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  76.56 
 
 
76 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  71.88 
 
 
75 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  73.44 
 
 
88 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  53.93 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  51.11 
 
 
97 aa  104  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  62.5 
 
 
74 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  49.45 
 
 
96 aa  103  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  67.19 
 
 
76 aa  103  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  67.16 
 
 
84 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  67.19 
 
 
81 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  71.88 
 
 
76 aa  100  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  65.67 
 
 
80 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  65.67 
 
 
80 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  65.62 
 
 
76 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  70.49 
 
 
75 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  55.56 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  63.49 
 
 
74 aa  95.5  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  63.08 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  65.08 
 
 
90 aa  92  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  65.08 
 
 
70 aa  92  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 
143 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 
133 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  50 
 
 
105 aa  90.5  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
78 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  59.42 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  53.16 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  60.94 
 
 
78 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 
89 aa  87.4  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  63.93 
 
 
81 aa  87.8  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  52.24 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  55.88 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
77 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
77 aa  87.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
77 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
77 aa  87.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
77 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
77 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  56.52 
 
 
75 aa  87  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
80 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  56.52 
 
 
75 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  57.35 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 
83 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 
74 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0928  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 
73 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0375041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  60.61 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1086  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 
73 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000857615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 
103 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 
80 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 
80 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  56.52 
 
 
74 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  42.86 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 
75 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 
75 aa  84  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  84.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  60 
 
 
91 aa  83.6  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  83.6  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  83.6  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  55.07 
 
 
74 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 
75 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  56.92 
 
 
77 aa  82.8  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  54.67 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  56.92 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  71.15 
 
 
73 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  71.15 
 
 
73 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  72.55 
 
 
71 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>