More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0026 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 75 aa  149  2e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  87.3 
 
 		 76 aa  111  3e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 78 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 77 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 77 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 77 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 77 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 77 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 77 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 77 aa  100  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 77 aa  100  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 77 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 77 aa  100  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  71.88 
 
 		 78 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  69.7 
 
 		 80 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  62.32 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  68.18 
 
 		 80 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  67.69 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  68.18 
 
 		 80 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  65.22 
 
 		 81 aa  94.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  64.62 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  64.62 
 
 		 94 aa  92  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  66.13 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  60.27 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 83 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  57.75 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  62.69 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  65 
 
 		 65 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  57.75 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  59.15 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  67.24 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  60.94 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  54.29 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09983  ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.596989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  55.38 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  56.16 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  56.52 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  56.52 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  50.67 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  52.17 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  48.48 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  60.34 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  49.33 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1211  SSU ribosomal protein S18P  54.41 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114712  normal  0.854081 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  62.3 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1788  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685938  normal  0.111131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0889  SSU ribosomal protein S18P  58.93 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>