More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1095 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 86 aa  176  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  73.26 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1351  30S ribosomal protein S18  71.76 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1829  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 87 aa  131  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1411  30S ribosomal protein S18  68.24 
 
 		 87 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000532082  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2023  30S ribosomal protein S18  69.41 
 
 		 87 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.344457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  66.15 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  63.24 
 
 		 81 aa  94  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  55.84 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  55.84 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  64.38 
 
 		 75 aa  90.9  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  54.67 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 		 80 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 		 80 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  56.52 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  62.9 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 97 aa  84.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  55.41 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  63.49 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  47.89 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  51.39 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  56.16 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  56.94 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  51.35 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  47.06 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  47.06 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  53.52 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1086  30S ribosomal protein S18  49.35 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000857615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  46.38 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0928  30S ribosomal protein S18  49.35 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0375041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  52.05 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  56.25 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  48.53 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>