More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2379 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  100 
 
 		 112 aa  224  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  40.87 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  45.45 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  43.56 
 
 		 106 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  51.81 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  51.81 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 80 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 80 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  60.66 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 80 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 80 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 80 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 77 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  47.25 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  42.42 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  61.29 
 
 		 70 aa  87.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 78 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  51.9 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  50.63 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  48.19 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  57.75 
 
 		 75 aa  85.5  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  51.39 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  49.32 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  53.52 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  46.75 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  59.02 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  55.74 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  49.32 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  55.74 
 
 		 75 aa  83.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  49.32 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  50 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  52.46 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  56.25 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  55.74 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  48.48 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0331  30S ribosomal protein S18  60.34 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  47.89 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  54.84 
 
 		 74 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0560  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.152801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  50.79 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  56.94 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1086  30S ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 73 aa  80.1  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000857615  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0928  30S ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 73 aa  80.1  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0375041  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  44.71 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  53.23 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0313  30S ribosomal protein S18  60.34 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000570063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  55.74 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  50 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  54.24 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 79 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  50.79 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  50 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>