More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2523 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 78 aa  154  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  91.03 
 
 		 78 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  85.19 
 
 		 81 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  80.77 
 
 		 78 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  94.87 
 
 		 78 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  93.59 
 
 		 78 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  93.59 
 
 		 78 aa  126  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  91.03 
 
 		 78 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23240  30S ribosomal protein S18  78.21 
 
 		 79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  76.92 
 
 		 79 aa  124  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  76.92 
 
 		 79 aa  124  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  79.75 
 
 		 79 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  77.22 
 
 		 79 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  77.22 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  71.79 
 
 		 78 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  71.79 
 
 		 78 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 		 78 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 78 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0310  ribosomal protein S18  75.41 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0899357 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1217  30S ribosomal protein S18  72.13 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.86687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  79.66 
 
 		 78 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0604  ribosomal protein S18  63.89 
 
 		 77 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  77.97 
 
 		 78 aa  97.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  78.18 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  74.14 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  78.18 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5492  30S ribosomal protein S18  68.75 
 
 		 83 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.115937  normal  0.0428851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  76.36 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  69.35 
 
 		 82 aa  90.9  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  74.55 
 
 		 78 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2341  ribosomal protein S18  66.2 
 
 		 85 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.159544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  59.52 
 
 		 84 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  59.52 
 
 		 84 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  70.97 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  59.52 
 
 		 84 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  70.91 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6032  30S ribosomal protein S18  70.97 
 
 		 87 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  54.93 
 
 		 86 aa  87  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1309  ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 63 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  67.27 
 
 		 85 aa  84.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  55.07 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1465  ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159175  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  59.42 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12092  30S ribosomal protein S18  62.82 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000379639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  47.83 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 79 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 79 aa  74.3  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  55 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  56.14 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  60.34 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  56.67 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 73 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3294  ribosomal protein S18  50.68 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 73 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  51.32 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 80 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  57.41 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 80 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2356  30S ribosomal protein S18  47.37 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160998  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3488  30S ribosomal protein S18  44.74 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.329035  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1692  30S ribosomal protein S18  46.05 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  62.26 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  48.44 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  54.39 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  49.23 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2463  30S ribosomal protein S18  43.42 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1519  30S ribosomal protein S18  43.42 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114713  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  59.65 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2986  30S ribosomal protein S18  43.42 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  49.23 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  48.44 
 
 		 71 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  49.23 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  46.58 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>