More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10054 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  100 
 
 
84 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  91.67 
 
 
84 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  91.67 
 
 
84 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  91.67 
 
 
84 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  87.5 
 
 
88 aa  151  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6032  30S ribosomal protein S18  88.51 
 
 
87 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  66.27 
 
 
85 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  68.24 
 
 
85 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 
78 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  63.1 
 
 
78 aa  110  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 
78 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  75.38 
 
 
78 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  66.23 
 
 
78 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  63.1 
 
 
78 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  76.92 
 
 
78 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  75.38 
 
 
78 aa  107  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  72.31 
 
 
78 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  65.33 
 
 
78 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  74.24 
 
 
79 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  71.01 
 
 
82 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  70.77 
 
 
78 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  67.69 
 
 
78 aa  100  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  65.48 
 
 
81 aa  99.4  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  63.93 
 
 
86 aa  92.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  64.06 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  60 
 
 
78 aa  92  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  61.64 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  72.13 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  60 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  64.79 
 
 
78 aa  90.1  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  72.13 
 
 
78 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23240  30S ribosomal protein S18  60 
 
 
79 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  65 
 
 
86 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  62.3 
 
 
87 aa  88.6  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  56.47 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  56.47 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  71.19 
 
 
78 aa  87.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 
94 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  55.95 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  74.55 
 
 
93 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  53.66 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  74.55 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  74.55 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 
96 aa  84.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  54.67 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 
110 aa  84  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  52 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 
80 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 
80 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  56.67 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  59.02 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1217  30S ribosomal protein S18  62.3 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.86687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  54.69 
 
 
74 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0310  ribosomal protein S18  63.93 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0899357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  53.23 
 
 
77 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  54.84 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  59.68 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 
76 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  58.06 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  54.84 
 
 
75 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  43.59 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  58.73 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  59.68 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  54.1 
 
 
74 aa  78.2  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  46.05 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2341  ribosomal protein S18  56.25 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.159544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0604  ribosomal protein S18  50 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  55.56 
 
 
91 aa  76.6  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  53.97 
 
 
76 aa  77  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  46.15 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  52.38 
 
 
76 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  50.82 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5492  30S ribosomal protein S18  51.32 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.115937  normal  0.0428851 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  55.56 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1309  ribosomal protein S18  57.63 
 
 
63 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  55 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1465  ribosomal protein S18  46.99 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  49.18 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  49.18 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 
92 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  49.18 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1411  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 
87 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000532082  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1351  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  50.82 
 
 
75 aa  72.8  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  46.75 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  50 
 
 
116 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  44.62 
 
 
76 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2023  30S ribosomal protein S18  50.79 
 
 
87 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.344457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  48.33 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  50.79 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  51.61 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>