More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3677 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  92.31 
 
 		 92 aa  173  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  92.31 
 
 		 92 aa  173  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  80.23 
 
 		 103 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  84.81 
 
 		 110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  79.07 
 
 		 106 aa  144  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  75 
 
 		 94 aa  144  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  72.22 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  73.13 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  68.85 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  70.49 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  70.49 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  70.49 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  61.04 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 		 80 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 		 80 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 89 aa  97.8  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  66.67 
 
 		 106 aa  97.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  68.25 
 
 		 97 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  68.25 
 
 		 96 aa  95.9  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  73.33 
 
 		 76 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  65.67 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  67.74 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1411  30S ribosomal protein S18  60.53 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000532082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  60.53 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  63.49 
 
 		 74 aa  92  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2023  30S ribosomal protein S18  59.21 
 
 		 87 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.344457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  70 
 
 		 75 aa  90.1  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  68.33 
 
 		 88 aa  90.1  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  65.08 
 
 		 76 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1351  30S ribosomal protein S18  59.21 
 
 		 87 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  67.21 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  56.94 
 
 		 75 aa  87  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 81 aa  87  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  51.81 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  56.92 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  63.33 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  59.68 
 
 		 75 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1829  30S ribosomal protein S18  48.68 
 
 		 87 aa  84.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  46.51 
 
 		 112 aa  84.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  54.67 
 
 		 84 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  50 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 74 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  61.29 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  49.38 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  51.85 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  64.41 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  59.68 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>