More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14781 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 73 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  95.89 
 
 		 73 aa  142  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  95.89 
 
 		 73 aa  142  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  89.04 
 
 		 73 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  89.04 
 
 		 73 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  87.67 
 
 		 73 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  87.67 
 
 		 73 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  87.67 
 
 		 73 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  87.67 
 
 		 73 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  87.67 
 
 		 73 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  78.57 
 
 		 71 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3729  30S ribosomal protein S18  73.24 
 
 		 72 aa  120  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  75.71 
 
 		 71 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  78.57 
 
 		 71 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  72.86 
 
 		 71 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  74.29 
 
 		 71 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  74.29 
 
 		 71 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  72.86 
 
 		 71 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  67.86 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  72.22 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  72.22 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  70.37 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  64.81 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  55.36 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  55.36 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  67.31 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  64.81 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  64.81 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  59.32 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  59.32 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  60.38 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  60.38 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  52.86 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  60.38 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  48.53 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  62.75 
 
 		 70 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1549  30S ribosomal protein S18  44.59 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1434  30S ribosomal protein S18  44.59 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  50.67 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  68 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0185  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1217  30S ribosomal protein S18  59.26 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.86687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3362  ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0493  30S ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1415  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  60.78 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  56.36 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3119  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.258718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  62.75 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  44.59 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  59.26 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  57.41 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  57.41 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  56.67 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  62.75 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  56.67 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  55.56 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  55.36 
 
 		 76 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5420  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0173473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>