More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1776 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1776  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 92 aa  180  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0829  ribosomal protein S18  80.22 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  55.91 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  58.62 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  54.39 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  54.24 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  49.33 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  56.9 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  56.14 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 71 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3903  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000287817  normal  0.152503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  40.66 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3729  30S ribosomal protein S18  50.91 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  46.67 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2779  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000612799  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  61.22 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  46.67 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  55.17 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00021  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002334  SSU ribosomal protein S18p  53.85 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.134261  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  59.18 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  58 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  51.72 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  54.39 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  58 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2764  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07650  30S ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1058  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0889  SSU ribosomal protein S18P  50.98 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5420  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0173473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0646  30S ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.934429  hitchhiker  0.000938781 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4876  30S ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5661  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4667  30S ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0382262 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  57.69 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3637  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0682  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0448  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435788 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  50.94 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4757  30S ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1917  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1479  ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65170  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4933  30S ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000854262 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3782  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  44.12 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3362  ribosomal protein S18  54 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>