More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1211 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1211  SSU ribosomal protein S18P  100 
 
 
84 aa  168  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114712  normal  0.854081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1917  30S ribosomal protein S18  79.75 
 
 
82 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0454  30S ribosomal protein S18  78.48 
 
 
82 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234797  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0460  30S ribosomal protein S18  78.48 
 
 
82 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0568  30S ribosomal protein S18  78.48 
 
 
82 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2986  30S ribosomal protein S18  83.56 
 
 
79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3488  30S ribosomal protein S18  83.56 
 
 
79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.329035  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  84.93 
 
 
75 aa  124  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1692  30S ribosomal protein S18  76.92 
 
 
79 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240883  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2356  30S ribosomal protein S18  76.92 
 
 
79 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  85.14 
 
 
95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2463  30S ribosomal protein S18  83.56 
 
 
79 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  84.93 
 
 
75 aa  123  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0740  30S ribosomal protein S18  74.07 
 
 
82 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2295  30S ribosomal protein S18  82.19 
 
 
79 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0262135  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1196  30S ribosomal protein S18  76.25 
 
 
82 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215666  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  83.56 
 
 
75 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  83.56 
 
 
75 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  83.56 
 
 
75 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  83.56 
 
 
75 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1053  30S ribosomal protein S18  76.25 
 
 
82 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1519  30S ribosomal protein S18  75 
 
 
82 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  86.96 
 
 
92 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  80.82 
 
 
91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0493  30S ribosomal protein S18  75 
 
 
82 aa  117  7e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1415  30S ribosomal protein S18  77.46 
 
 
74 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3119  30S ribosomal protein S18  77.78 
 
 
88 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.258718  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1901  30S ribosomal protein S18  74.65 
 
 
74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3362  ribosomal protein S18  83.08 
 
 
81 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3814  30S ribosomal protein S18  84.38 
 
 
79 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295923  normal  0.120309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1621  30S ribosomal protein S18  75.34 
 
 
75 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0249871  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3941  30S ribosomal protein S18  82.81 
 
 
84 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.182221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4416  30S ribosomal protein S18  82.81 
 
 
84 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4309  30S ribosomal protein S18  82.81 
 
 
84 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0685461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5420  30S ribosomal protein S18  82.81 
 
 
83 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0173473  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  73.24 
 
 
74 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0413  30S ribosomal protein S18  82.81 
 
 
78 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0899  30S ribosomal protein S18  81.25 
 
 
80 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0242171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2304  30S ribosomal protein S18  81.25 
 
 
80 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.554922  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2591  30S ribosomal protein S18  81.25 
 
 
83 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4636  30S ribosomal protein S18  81.25 
 
 
82 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  65.75 
 
 
106 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
74 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  63.24 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  63.24 
 
 
74 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
75 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
75 aa  88.2  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
76 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
75 aa  87.8  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
76 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
78 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  86.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  86.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  86.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  60.29 
 
 
74 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04069  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0373  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
77 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04031  hypothetical protein  60.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  61.19 
 
 
74 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 
76 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>