243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28311 on replicon NC_009371
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009371  OSTLU_28311  ABC(binding protein) family transporter: polyamine  100 
 
 
388 aa  775    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011934  hitchhiker  0.000840436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2833  periplasmic polyamine-binding protein of ABC transporter  30.21 
 
 
382 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16753  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2014  periplasmic polyamine-binding protein  30.73 
 
 
384 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3259  periplasmic polyamine-binding protein  31.68 
 
 
391 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2862  hypothetical protein  31.37 
 
 
391 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000423917  decreased coverage  0.000103772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3062  periplasmic polyamine-binding protein of ABC transporter  28 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3417  family 1 extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3972  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.92 
 
 
377 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.107173 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2266  periplasmic polyamine-binding protein of ABC transporter  31.6 
 
 
354 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.242128  normal  0.482292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0124  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2708  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15362  normal  0.342608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2567  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3147  periplasmic polyamine-binding protein, putative  28.3 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718398  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0917  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0241526  normal  0.315569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5404  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
375 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000245963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0281  putative polyamine-binding lipoprotein  27.15 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.565719  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3929  family 1 extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156398  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0310  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1703  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0873  periplasmic polyamine-binding protein, putative  28.08 
 
 
359 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0903  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
359 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551806  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2302  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
360 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4305  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
359 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
350 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7525  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.73 
 
 
372 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1531  polyamine transport protein PotD  27.68 
 
 
353 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0979  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  28.89 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17610  polyamine ABC transporter  27.68 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1367  transcription factor jumonji, jmjC  26.88 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  28.12 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0407  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000173672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
367 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1368  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.94 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1408  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.121808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.81 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0561958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2829  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 
362 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  28.92 
 
 
349 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
366 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  28.92 
 
 
349 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1108  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  27.11 
 
 
357 aa  60.1  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
366 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  28.92 
 
 
345 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1011  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.82 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  28.92 
 
 
345 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
366 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1030  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.82 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491177  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0982  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.82 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2406  putrescine-binding periplasmic protein precursor  27.42 
 
 
362 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  hitchhiker  0.00509094 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0914  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.82 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  28.92 
 
 
349 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  28.92 
 
 
349 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  28.92 
 
 
349 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
357 aa  59.7  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  28.92 
 
 
349 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
387 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  28.31 
 
 
349 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2394  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.63 
 
 
358 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  27.98 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0081  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  24.6 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0373558  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2677  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0163621 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1203  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0468  ABC transport protein  29.02 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6065  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
364 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00859  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.94 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2788  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2477  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.94 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.996224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1010  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.94 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  normal  0.285031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0882  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.94 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0957  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.94 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00865  hypothetical protein  23.94 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2742  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.94 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.602994  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  25.82 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4396  putrescine ABC transporter periplasmic putrescine-binding protein  27.22 
 
 
362 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1493  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  26.04 
 
 
355 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0950  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.47 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06341  hypothetical protein  26.75 
 
 
339 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.150904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2577  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0926  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.94 
 
 
370 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0194  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.89 
 
 
359 aa  57.4  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
366 aa  57  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1454  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  23.55 
 
 
336 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.26 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
357 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5306  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  29.38 
 
 
374 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
401 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 
366 aa  56.2  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  23.98 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1556  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.27 
 
 
367 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>