57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1206 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  100 
 
 		 258 aa  504  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 272 aa  221  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  48.11 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  50.2 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  46.33 
 
 		 268 aa  188  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  33.71 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  31.34 
 
 		 352 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  28.4 
 
 		 285 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  36.78 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  33.2 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 334 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1514  transcriptional regulator, PaaX family  29.37 
 
 		 316 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  31.87 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 334 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  28.74 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  34.43 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  28.74 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  28.74 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0309  transcriptional regulator, PaaX family  32.93 
 
 		 302 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  31.45 
 
 		 307 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  30.12 
 
 		 281 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 333 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1521  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  26.83 
 
 		 312 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  33.58 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  35.04 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7200  transcriptional regulator, PaaX family  29.53 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  22.31 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  31.18 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  28.29 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4812  PaaX domain-containing protein  33.08 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.33483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0216  PaaX family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0165647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  29.07 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5085  PaaX domain-containing protein, C- domain  34.04 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3357  transcriptional regulator, PaaX family  29.12 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10688  hypothetical protein  32.05 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  33.47 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  27.53 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  26.62 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  28.46 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0094  PaaX family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  31.05 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  31.05 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  31.05 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4285  PaaX domain protein protein domain protein  31.67 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246767  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  29.02 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0436  PaaX-like  25.71 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.581976 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3828  PaaX family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>