56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0703 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  52.33 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  50 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  48.11 
 
 		 258 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  33.09 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  26.54 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 307 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  33.33 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  32.83 
 
 		 316 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  32.83 
 
 		 316 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  32.45 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  36.12 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  28.36 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  30.71 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  33.61 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 334 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  31.65 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1514  transcriptional regulator, PaaX family  28.94 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 307 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1521  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  29.32 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  31.58 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  34.02 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  27.94 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  24.68 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  26.82 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0309  transcriptional regulator, PaaX family  29.76 
 
 		 302 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0216  PaaX family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0165647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  32.18 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7200  transcriptional regulator, PaaX family  29.23 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  29.02 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3357  transcriptional regulator, PaaX family  29.17 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4812  PaaX domain-containing protein  29.66 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.33483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  27.38 
 
 		 292 aa  72  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0094  PaaX family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  30.04 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  28.51 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  25.1 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4285  PaaX domain protein protein domain protein  27.68 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246767  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  29.24 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  29.24 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  29.24 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10688  hypothetical protein  26.27 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  26.59 
 
 		 237 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5085  PaaX domain-containing protein, C- domain  27.38 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3828  PaaX family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>