58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2246 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  100 
 
 		 316 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  99.37 
 
 		 316 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  99.05 
 
 		 316 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  99.05 
 
 		 316 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 312 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 334 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 307 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  42.43 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  42.43 
 
 		 334 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1521  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  37.46 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  36.61 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  37.06 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  36.24 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  37.66 
 
 		 352 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0216  PaaX family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0165647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  34.96 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1514  transcriptional regulator, PaaX family  35.96 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  38.01 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  35.42 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7200  transcriptional regulator, PaaX family  35.19 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  29.84 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3357  transcriptional regulator, PaaX family  30.85 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0094  PaaX family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  32.83 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  30.65 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  31.3 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4812  PaaX domain-containing protein  30.18 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.33483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  30 
 
 		 259 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  28.74 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  28.63 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  28.16 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  29.71 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  29.15 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  26.21 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  27.82 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3828  PaaX family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  27.06 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  26.44 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0436  PaaX-like  24.72 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.581976 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0309  transcriptional regulator, PaaX family  25.28 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  26.23 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0659  PaaX-like  32.97 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.702789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  28.44 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  28.44 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  28.44 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5085  PaaX domain-containing protein, C- domain  28.77 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10688  hypothetical protein  29.49 
 
 		 240 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  27.73 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  26.94 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0915  PaaX domain-containing protein  27.44 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>