59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0196 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  100 
 
 		 319 aa  640    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1521  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  48.37 
 
 		 312 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  36.27 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  36.61 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  36.61 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  36.57 
 
 		 352 aa  202  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0216  PaaX family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0165647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  36.11 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1514  transcriptional regulator, PaaX family  40.4 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  29.87 
 
 		 285 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7200  transcriptional regulator, PaaX family  37.89 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  34.62 
 
 		 287 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  28.22 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  34.13 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  27 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3357  transcriptional regulator, PaaX family  31.51 
 
 		 301 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4812  PaaX domain-containing protein  33.22 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.33483 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0094  PaaX family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  29.64 
 
 		 259 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  28.99 
 
 		 289 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  29.69 
 
 		 281 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  29.88 
 
 		 258 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  27.05 
 
 		 260 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  29.36 
 
 		 268 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  27.16 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  31.1 
 
 		 276 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 259 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  29.15 
 
 		 260 aa  85.9  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  28.4 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  26.48 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  28.23 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5085  PaaX domain-containing protein, C- domain  28.96 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  29.67 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  29.67 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  29.67 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3828  PaaX family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  28.16 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10688  hypothetical protein  28.63 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0436  PaaX-like  26.02 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.581976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  27.31 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0309  transcriptional regulator, PaaX family  24.12 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  25.87 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  23.72 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4285  PaaX domain protein protein domain protein  26.52 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246767  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0524  hypothetical protein  27.75 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0058  hypothetical protein  26.84 
 
 		 278 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>