54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0995 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  100 
 
 		 243 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  100 
 
 		 243 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  100 
 
 		 243 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  75.42 
 
 		 237 aa  345  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10688  hypothetical protein  71.37 
 
 		 240 aa  334  9e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5085  PaaX domain-containing protein, C- domain  70.95 
 
 		 244 aa  332  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4285  PaaX domain protein protein domain protein  47.83 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6140  putative transcriptional regulator, PaaX family  52.89 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.192867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  24.78 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  29.82 
 
 		 292 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  29.67 
 
 		 319 aa  65.1  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  31.08 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  32.65 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  24.66 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  29.57 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  28.38 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  25.31 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  28.9 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  28.64 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  32.29 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  29.24 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 272 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0915  PaaX domain-containing protein  30.3 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  32.05 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  29.6 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  27.44 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  28.5 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  29.41 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  29.82 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  28.44 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 334 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0524  hypothetical protein  25.55 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  28.42 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  25 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  26.29 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2726  hypothetical protein  29.02 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0283  hypothetical protein  29.02 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3480  hypothetical protein  29.02 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1827  hypothetical protein  29.02 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0069  hypothetical protein  29.02 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0067  hypothetical protein  29.02 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  29.46 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 334 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0058  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 333 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 307 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>