18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0283 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0283  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2726  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0067  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0069  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1827  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3480  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0058  hypothetical protein  97.48 
 
 
278 aa  520  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0524  hypothetical protein  54.62 
 
 
281 aa  285  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0915  PaaX domain-containing protein  56.08 
 
 
275 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3911  PaaX-like  44.59 
 
 
239 aa  192  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.547243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00945  PaaX-like protein  32.95 
 
 
266 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067887  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4285  PaaX domain protein protein domain protein  30.84 
 
 
244 aa  49.7  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246767  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  28.95 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10688  hypothetical protein  27.51 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  29.02 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  29.02 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  29.02 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  28.57 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>