More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0458 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0458  putative cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  56.57 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  54.97 
 
 		 974 aa  221  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  54.97 
 
 		 962 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0081  putative cytochrome c oxidase subunit III  58.5 
 
 		 217 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379927  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  54.97 
 
 		 950 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2185  putative cytochrome c oxidase, subunit III  57 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0357507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  54.64 
 
 		 882 aa  214  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  54.08 
 
 		 879 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  54.08 
 
 		 879 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5489  cytochrome c oxidase subunit III  58.95 
 
 		 208 aa  207  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  54.64 
 
 		 879 aa  205  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  54.79 
 
 		 876 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  46.46 
 
 		 1004 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  33.68 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  34.29 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  32.18 
 
 		 198 aa  98.6  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  33.71 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  33.14 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 		 268 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  38.19 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  39.16 
 
 		 266 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  34.27 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  33.91 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1447  cytochrome c oxidase, subunit III  29.41 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.703222  normal  0.345478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  31.61 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.31 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  36.67 
 
 		 279 aa  94.7  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  36.05 
 
 		 292 aa  93.2  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  38 
 
 		 292 aa  93.2  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  38 
 
 		 439 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  30.64 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  31.89 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  38 
 
 		 292 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  36.73 
 
 		 293 aa  92.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  35.37 
 
 		 284 aa  92  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  32.57 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  32.57 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  29.51 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  36.05 
 
 		 292 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  31.82 
 
 		 283 aa  89.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  34.67 
 
 		 292 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3381  cytochrome c oxidase subunit III  33.9 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  29.41 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  32.09 
 
 		 285 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  34.23 
 
 		 288 aa  88.2  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  34.12 
 
 		 291 aa  88.2  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  30.46 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  32.77 
 
 		 319 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  34.64 
 
 		 284 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  30.46 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  34.69 
 
 		 292 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  33.14 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  30.46 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  32.62 
 
 		 284 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1829  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  39.86 
 
 		 266 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  33.12 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 		 266 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  32.9 
 
 		 286 aa  85.9  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  36.46 
 
 		 743 aa  85.5  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  38.35 
 
 		 288 aa  84.7  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  36.43 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  33.75 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  35.39 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  29.65 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  34.01 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  34.69 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  34.69 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  34.97 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  31.07 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  30.61 
 
 		 818 aa  82.8  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  32.24 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  33.5 
 
 		 832 aa  82.4  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  31.75 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  35.81 
 
 		 288 aa  81.6  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  32.09 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  31.55 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  35.34 
 
 		 286 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  36.49 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  37.78 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  35.06 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  35.06 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  32.77 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  35.06 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0260  cytochrome c oxidase, subunit III  34.01 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3458  cytochrome c oxidase, subunit III  34.01 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  38.06 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  35.06 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  35.06 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  35.29 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  36.42 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  35.06 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  32.43 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  31.77 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  32.43 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>