More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3381 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3381  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
204 aa  394  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  41.44 
 
 
962 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  41.44 
 
 
974 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  41.44 
 
 
950 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  34.31 
 
 
214 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5489  cytochrome c oxidase subunit III  36.76 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2185  putative cytochrome c oxidase, subunit III  36.67 
 
 
217 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0357507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0458  putative cytochrome c oxidase subunit I  36.16 
 
 
201 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0081  putative cytochrome c oxidase subunit III  35.03 
 
 
217 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379927  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  37.07 
 
 
879 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  37.07 
 
 
879 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  37.57 
 
 
882 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  40.88 
 
 
876 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  37.57 
 
 
879 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  28.19 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.47 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  30.72 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  30.6 
 
 
743 aa  68.6  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  24.23 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  27.27 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  29.83 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0481  cytochrome c oxidase subunit III  31.87 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  37.5 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  30.24 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  24.74 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1371  ubiquinol oxidase, subunit III  30.24 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.819538  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0227  ubiquinol oxidase, subunit III  30.24 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2570  ubiquinol oxidase, subunit III  30.24 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  32.31 
 
 
293 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  29.68 
 
 
291 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  31.21 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0431  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.84 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1327  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.12 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0196  ubiquinol oxidase, subunit III  29.76 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  30.24 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3062  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.36 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119037  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3100  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.36 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3243  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.36 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.25 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3825  cytochrome c oxidase, subunit III  28.81 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0572174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3916  cytochrome c oxidase, subunit III  26.86 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4033  cytochrome c oxidase, subunit III  28.81 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  24.86 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  27.81 
 
 
292 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  27.1 
 
 
286 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  33.15 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  30.34 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  25.79 
 
 
292 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  30.06 
 
 
283 aa  61.6  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  29.65 
 
 
208 aa  61.6  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.13 
 
 
204 aa  61.2  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0091  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.29 
 
 
203 aa  61.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  28.66 
 
 
295 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  28.95 
 
 
292 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  25.63 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114141  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  25.63 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0543  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  25.63 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  32.58 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  28.48 
 
 
292 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  29.63 
 
 
289 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  25.81 
 
 
286 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0488  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  25.63 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128023  hitchhiker  0.00584206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  28.66 
 
 
295 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  26.77 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0480  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  25.63 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0470237  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5791  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.92 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0858154 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  32.58 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  25.79 
 
 
292 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  30.51 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  32.58 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00381  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.13 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00313759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.13 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  27.68 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  27.22 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1143  cytochrome c oxidase, subunit III  26.55 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537108  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.13 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00385  hypothetical protein  26.13 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00541093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0991  ubiquinol oxidase, subunit III  29.76 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.532758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  26.22 
 
 
295 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0505  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.13 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00786861  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  25.63 
 
 
285 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03910  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III (Ubiquinol oxidase chain C)  26.55 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4374  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.84 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  25.81 
 
 
286 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.13 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
439 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  29.21 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  29.05 
 
 
293 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 
796 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  27.1 
 
 
286 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.13 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  27.1 
 
 
286 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  29.81 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  27.74 
 
 
288 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2716  ubiquinol oxidase, subunit III  28.1 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.089432  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  25.13 
 
 
284 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2105  cytochrome c oxidase, subunit III  32.42 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  23.12 
 
 
274 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>