More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5489 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5489  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 208 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  74.52 
 
 		 214 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0081  putative cytochrome c oxidase subunit III  74.76 
 
 		 217 aa  294  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379927  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2185  putative cytochrome c oxidase, subunit III  72.77 
 
 		 217 aa  293  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0357507 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  67.36 
 
 		 974 aa  262  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  67.36 
 
 		 962 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  66.84 
 
 		 950 aa  257  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  66.84 
 
 		 882 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  67.02 
 
 		 879 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  67.02 
 
 		 879 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  66.32 
 
 		 879 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  68.09 
 
 		 876 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0458  putative cytochrome c oxidase subunit I  58.95 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  64.46 
 
 		 1004 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  37.21 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  35.75 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1447  cytochrome c oxidase, subunit III  35.18 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.703222  normal  0.345478 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3381  cytochrome c oxidase subunit III  39.04 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  32.58 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  29.7 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  31.67 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  35.1 
 
 		 293 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  32.37 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  31.25 
 
 		 206 aa  89  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  33.89 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  33.89 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  34.21 
 
 		 268 aa  88.2  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  32.12 
 
 		 283 aa  88.6  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  31.4 
 
 		 274 aa  88.2  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  31.21 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  35.76 
 
 		 292 aa  85.9  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  33.11 
 
 		 292 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  33.7 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  33.71 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  36.46 
 
 		 743 aa  85.1  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  34.44 
 
 		 292 aa  85.1  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  33.77 
 
 		 439 aa  84.7  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  36.62 
 
 		 291 aa  84.7  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  33.77 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  32.7 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  32.43 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  28.19 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  31.28 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  32.67 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  33.11 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  26.96 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  30.6 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 285 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  35.37 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  32.65 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  32.65 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  31.49 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  31.32 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  34.46 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  27.54 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1242  cytochrome c oxidase subunit III  31.37 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.993936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  31.32 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  32.65 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  35.71 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  30.46 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  31.76 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  31.1 
 
 		 806 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  32.03 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  33.9 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  35.71 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  31.86 
 
 		 832 aa  79  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  32.43 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  30.88 
 
 		 819 aa  78.6  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  30.95 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  33.12 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  30.87 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  30.87 
 
 		 285 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  34.51 
 
 		 291 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  32.45 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  36.9 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  35.63 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  33.9 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  31.07 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  34.62 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  33.1 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  31.29 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  31.97 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  31.54 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  31.54 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  31.94 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  32.77 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  31.29 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  29.83 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  29.45 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>