More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0774 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0774  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
263 aa  529  1e-149  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0166935 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1464  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.77 
 
 
291 aa  117  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.879839  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0795  Sec-independent protein translocase TatC  28.57 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.166427  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0725  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.84 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000256296 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.92 
 
 
259 aa  109  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3820  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.55 
 
 
297 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00172839  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.12 
 
 
251 aa  105  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1460  Sec-independent protein translocase TatC  30.04 
 
 
270 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.403826  normal  0.0434954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.92 
 
 
324 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.46 
 
 
247 aa  102  8e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30 
 
 
257 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0850  Sec-independent periplasmic protein translocase  26.39 
 
 
289 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0556055  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  30.16 
 
 
246 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.47 
 
 
257 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.3 
 
 
246 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.92 
 
 
264 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.25 
 
 
242 aa  99  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.97 
 
 
253 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.97 
 
 
253 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1578  Sec-independent protein translocase TatC  31.69 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  32.61 
 
 
247 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.2 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.04 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.73 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43950  Tat family transporter: protein export TatC  26.77 
 
 
284 aa  96.7  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601024  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.47 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1229  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.38 
 
 
246 aa  96.3  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.672441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.88 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.54 
 
 
468 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.02 
 
 
264 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.59 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  28.12 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0387  Sec-independent protein translocase TatC  27.42 
 
 
264 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  0.89902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.04 
 
 
267 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  30.04 
 
 
267 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  27.31 
 
 
241 aa  94  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.02 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  26.27 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12353  putative Sec-independent protein translocase component  29.1 
 
 
281 aa  92.4  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2680  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.04 
 
 
389 aa  92  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.467706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.1 
 
 
249 aa  92  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04641  Tat family protein secretion protein  28.46 
 
 
264 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.174125  normal  0.993499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.87 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1889  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.52 
 
 
348 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.824369  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  24.61 
 
 
250 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.07 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  24.21 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0630  Sec-independent protein translocase TatC  28.9 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.59388  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0997  Sec-independent periplasmic protein translocase  30.15 
 
 
734 aa  90.5  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3363  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.73 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00118614  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.38 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  30.11 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  29.02 
 
 
299 aa  90.1  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  27.69 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  29.15 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.65 
 
 
321 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  23.41 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  23.81 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.48 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.44 
 
 
283 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  28.11 
 
 
230 aa  89.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  29.73 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4289  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.51 
 
 
255 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  27.56 
 
 
265 aa  89  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4349  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.51 
 
 
255 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.13 
 
 
261 aa  88.6  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1486  MttB family protein  28.2 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255832  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  28.46 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  29.73 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  28.4 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.04 
 
 
269 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0125  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.51 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1656  Sec-independent periplasmic protein translocase  30.8 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  29.73 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.25 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3632  Sec-independent protein translocase TatC  28.73 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  29.19 
 
 
270 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.97 
 
 
275 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.17 
 
 
336 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  27.42 
 
 
269 aa  87  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.48 
 
 
262 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.48 
 
 
262 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18520  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  28.05 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.019467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1812  Sec-independent protein translocase TatC  25.5 
 
 
285 aa  86.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00710402  hitchhiker  0.000512966 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1535  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.96 
 
 
280 aa  85.9  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.08 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.04 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.69 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.24 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0071  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.62 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1387  Sec-independent periplasmic protein translocase  28.31 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.02646  normal  0.486674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  24.9 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3258  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.98 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.73 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05191  Tat family protein secretion protein  26.85 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.593552  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.85 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2061  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.02 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.17357 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  27.02 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.02 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1283  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.76 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>