48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0344 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0344  periplasmic binding protein  100 
 
 		 84 aa  176  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.560526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 		 478 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  39.29 
 
 		 483 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  44.29 
 
 		 380 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  40.54 
 
 		 358 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  45.45 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  39.44 
 
 		 380 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  37.8 
 
 		 354 aa  63.9  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  38.64 
 
 		 426 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  30.12 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  34.88 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  35.37 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  41.43 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  39.39 
 
 		 375 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  42.62 
 
 		 338 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  36.99 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  34.78 
 
 		 397 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  42.59 
 
 		 366 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  39.68 
 
 		 361 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  35.8 
 
 		 356 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 383 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  35.71 
 
 		 383 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  38.27 
 
 		 372 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  30.43 
 
 		 377 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  30.43 
 
 		 401 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  30.49 
 
 		 333 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  30.77 
 
 		 384 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  23.75 
 
 		 389 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  23.75 
 
 		 381 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 389 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 407 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  33.85 
 
 		 360 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  32.76 
 
 		 394 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2309  periplasmic binding protein  29.76 
 
 		 358 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 380 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  36.92 
 
 		 362 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  27.94 
 
 		 377 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 354 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28.57 
 
 		 406 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 365 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  30.56 
 
 		 371 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  28.79 
 
 		 392 aa  41.2  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.33 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 377 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.67 
 
 		 386 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 378 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  30 
 
 		 375 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  27.14 
 
 		 375 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>