61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0498 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0498  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 		 245 aa  489  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  59.57 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  50.21 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.737915  normal  0.562517 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1302  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  49.15 
 
 		 250 aa  214  7e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0854069 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1420  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  48.09 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.437364 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1353  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  47.66 
 
 		 243 aa  200  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0840  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  46.81 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.351261 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1007  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  47.6 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2720  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.93 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  42.04 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0763  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.59 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0101  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.82 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.937724  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1375  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.87 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01930  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  38.3 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.472382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2006  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.8 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1838  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.89 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.999311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1082  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.96 
 
 		 186 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1123  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.46 
 
 		 186 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2980  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.35 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.56 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0477  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like  32.02 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000127258  hitchhiker  0.0000923392 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1062  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.849255  normal  0.0474843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1321  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.63 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0781172  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2769  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.73 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00685843  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2618  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2724  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  32.5 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.369069 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0129  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  29.87 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000088129  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2040  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.87 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1562  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  24.64 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1799  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.72 
 
 		 175 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2140  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  33.72 
 
 		 191 aa  48.9  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1040  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.94 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000835341  hitchhiker  0.000130989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4088  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.83 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0694  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.96 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1412  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.93 
 
 		 174 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0782  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.43 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0334032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0115  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.1 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1246  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.4 
 
 		 212 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188109  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1015  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, putative  35.06 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0380852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1395  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.77 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2318  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.89 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1025  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.06 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.780063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1320  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.84 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3471  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.25 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0875486  normal  0.451491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1879  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.63 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23890  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  37.5 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1854  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  24.12 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1295  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.47 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4398  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.1 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3295  putative ligase  27.85 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000506404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1896  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.46 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.665904  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1179  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  38.89 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4345  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  29.55 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0992  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  34.29 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147922  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3298  putative ligase  27.85 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000163659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11010  hypothetical protein  32.14 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.765426 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1658  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.95 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00123721  normal  0.619809 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4701  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  25.21 
 
 		 187 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3159  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.21 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4118  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.55 
 
 		 192 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.03 
 
 		 204 aa  42  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.27126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>