41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0477 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0477  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like  100 
 
 		 238 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000127258  hitchhiker  0.0000923392 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.5 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0498  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.02 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0101  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.2 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.937724  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2980  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.15 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1420  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.89 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.437364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01930  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.73 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.472382 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1007  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.55 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1353  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.32 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0840  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.09 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.351261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.44 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971287  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1302  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.73 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0854069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0763  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.5 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  25.69 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.737915  normal  0.562517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1838  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.999311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2006  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.09 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2726  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  35.63 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2720  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.03 
 
 		 267 aa  52  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  25.77 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3649  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  35.14 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0828  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.23 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000562613  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32823  predicted protein  25.78 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194414  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3472  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.93 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2318  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0910  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.62 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3221  putative ligase  29.41 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000122518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3506  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.06 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2443  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.93 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1723  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  35.96 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3648  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  32.47 
 
 		 192 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1666  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  35.96 
 
 		 198 aa  42  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0938485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1896  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.25 
 
 		 201 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.665904  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32680  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  34.25 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.607571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3045  putative ligase  29.33 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1096  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.29 
 
 		 205 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.73998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0774  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  34.67 
 
 		 224 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1246  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2469  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.91 
 
 		 181 aa  41.6  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0350692 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02706  hypothetical protein  29.33 
 
 		 182 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000385282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02743  predicted ligase  29.33 
 
 		 182 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3070  putative ligase  29.33 
 
 		 182 aa  42  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000340547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>