21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1375 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1375  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 		 294 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  51.89 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0763  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  48.01 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2720  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  47.44 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1302  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.98 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0854069 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.02 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0840  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.46 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.351261 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.02 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.737915  normal  0.562517 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1420  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.64 
 
 		 243 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.437364 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1353  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.8 
 
 		 243 aa  162  7e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1838  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.37 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.999311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2006  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.58 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1007  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.89 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0498  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.87 
 
 		 245 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01930  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.93 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.472382 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0101  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.34 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.937724  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.18 
 
 		 246 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971287  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2980  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.62 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1123  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.99 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1082  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.55 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1589  zinc finger CHY domain protein  79.41 
 
 		 156 aa  53.5  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00180134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>