15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1589 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1589  zinc finger CHY domain protein  100 
 
 
156 aa  313  8e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00180134 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0331  zinc finger CHY domain protein  50 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2377  zinc finger CHY domain protein  49.62 
 
 
112 aa  124  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2415  zinc finger CHY domain protein  38.81 
 
 
120 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000840135  hitchhiker  0.00404962 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0404  hypothetical protein  33.08 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.55829  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3076  zinc finger CHY domain protein  38.17 
 
 
107 aa  90.5  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14490  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.302715  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0761  zinc finger CHY domain-containing protein  31.82 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.757091  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0778  zinc finger CHY domain-containing protein  31.82 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29946  predicted protein  35.56 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.781673  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0517  Zn-finger protein  32.31 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0612801  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0397  hypothetical protein  31.01 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1951  hypothetical protein  30.08 
 
 
100 aa  61.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0161954  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1375  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  79.41 
 
 
294 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01900  conserved hypothetical protein  41.82 
 
 
698 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>