13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2415 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2415  zinc finger CHY domain protein  100 
 
 		 120 aa  247  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000840135  hitchhiker  0.00404962 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0404  hypothetical protein  52.94 
 
 		 104 aa  130  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.55829  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3076  zinc finger CHY domain protein  59.26 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0761  zinc finger CHY domain-containing protein  50 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.757091  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0778  zinc finger CHY domain-containing protein  50 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2377  zinc finger CHY domain protein  50.94 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0331  zinc finger CHY domain protein  49.51 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1589  zinc finger CHY domain protein  38.81 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00180134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14490  hypothetical protein  51.79 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.302715  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29946  predicted protein  41.03 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1951  hypothetical protein  33.66 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0161954  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0517  Zn-finger protein  38.24 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0612801  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0397  hypothetical protein  36.36 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>