14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2377 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2377  zinc finger CHY domain protein  100 
 
 
112 aa  229  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0331  zinc finger CHY domain protein  63.46 
 
 
123 aa  146  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14490  hypothetical protein  59.09 
 
 
135 aa  127  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.302715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1589  zinc finger CHY domain protein  49.62 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00180134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3076  zinc finger CHY domain protein  53.85 
 
 
107 aa  117  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0761  zinc finger CHY domain-containing protein  48.08 
 
 
104 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.757091  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0778  zinc finger CHY domain-containing protein  48.08 
 
 
104 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2415  zinc finger CHY domain protein  50.94 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000840135  hitchhiker  0.00404962 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0404  hypothetical protein  45.1 
 
 
104 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.55829  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29946  predicted protein  46.23 
 
 
123 aa  101  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.781673  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0517  Zn-finger protein  40.59 
 
 
101 aa  87  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0612801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1951  hypothetical protein  41.18 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0161954  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0397  hypothetical protein  40.82 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00520  zinc finger protein, putative  36.23 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>