35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1353 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1353  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 		 243 aa  493  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0840  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  67.23 
 
 		 235 aa  347  1e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.351261 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1420  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  68.07 
 
 		 243 aa  342  2e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.437364 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  64.29 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.737915  normal  0.562517 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1302  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  64.98 
 
 		 250 aa  329  2e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0854069 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  55.65 
 
 		 241 aa  248  6e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0498  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  47.66 
 
 		 245 aa  200  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1007  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  45.11 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0763  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.16 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2720  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.16 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.68 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1375  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.8 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01930  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.68 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.472382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1838  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.7 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.999311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0101  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.89 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.937724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2006  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.41 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.52 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971287  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2980  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.51 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1082  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.67 
 
 		 186 aa  85.1  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1123  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.66 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0477  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like  27.75 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000127258  hitchhiker  0.0000923392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1179  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.17 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3294  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.81 
 
 		 191 aa  48.9  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3690  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0480146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0115  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.76 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1246  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.33 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4088  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.57 
 
 		 214 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3189  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0967  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.63 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00139952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1099  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.84 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000408688  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4041  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.11 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32823  predicted protein  26.67 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1025  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.49 
 
 		 196 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.780063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1321  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33 
 
 		 196 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0781172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8650  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.99 
 
 		 193 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>