34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2980 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2980  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.59 
 
 		 246 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971287  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0840  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.74 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.351261 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.16 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1302  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.76 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0854069 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1420  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.19 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.437364 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.19 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.737915  normal  0.562517 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0101  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.2 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.937724  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1353  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.51 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1007  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.91 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01930  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.78 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.472382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0763  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.72 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.48 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2006  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.42 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1838  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.24 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.999311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1375  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.62 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2720  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.67 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0498  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.51 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0477  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like  26.15 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000127258  hitchhiker  0.0000923392 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1082  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.57 
 
 		 186 aa  52  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3313  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.03 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0716599  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1123  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.14 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3298  putative ligase  33.71 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000163659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3295  putative ligase  33.71 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000506404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3221  putative ligase  32.58 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000122518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3332  putative ligase  32.22 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000964755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0798  putative ligase  32.22 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000314962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4205  putative ligase  32.22 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3239  putative ligase  32.22 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176162  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0781  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.22 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326158  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3045  putative ligase  31.11 
 
 		 200 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02706  hypothetical protein  31.11 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000385282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02743  predicted ligase  31.11 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3070  putative ligase  31.11 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000340547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>