30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0840 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0840  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.351261 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  79.22 
 
 		 243 aa  390  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.737915  normal  0.562517 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1420  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  76.72 
 
 		 243 aa  382  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.437364 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1302  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  74.89 
 
 		 250 aa  352  2e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0854069 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1353  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  67.23 
 
 		 243 aa  347  9e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  53.65 
 
 		 241 aa  241  7.999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1007  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  50 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0498  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  46.81 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1375  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.46 
 
 		 294 aa  168  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2720  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.5 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0763  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.89 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  38.86 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0101  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.84 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.937724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2006  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.09 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01930  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.48 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.472382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1838  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.67 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.999311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2980  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.74 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.87 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971287  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1082  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.56 
 
 		 186 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1123  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.02 
 
 		 186 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0477  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like  26.6 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000127258  hitchhiker  0.0000923392 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3294  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.11 
 
 		 191 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4088  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0967  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.8 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00139952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3313  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.63 
 
 		 195 aa  45.4  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0716599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3690  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.23 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0480146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1099  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.74 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000408688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1179  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.87 
 
 		 189 aa  42  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1674  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.83 
 
 		 246 aa  41.6  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1246  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.09 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>