20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1082 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1082  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 
186 aa  378  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1123  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  69.57 
 
 
186 aa  256  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0840  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.56 
 
 
235 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.351261 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0498  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.96 
 
 
245 aa  101  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1302  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.84 
 
 
250 aa  99  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0854069 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.14 
 
 
241 aa  98.6  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35 
 
 
243 aa  95.5  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.737915  normal  0.562517 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1420  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.5 
 
 
243 aa  94.4  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.437364 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1353  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.67 
 
 
243 aa  85.1  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1375  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.55 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0101  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.47 
 
 
243 aa  82  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.937724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2720  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.16 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2006  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.16 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.95 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1007  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  38.93 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0763  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.38 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1838  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.7 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.999311  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01930  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.66 
 
 
241 aa  67.8  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.472382 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2980  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.36 
 
 
245 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  25.49 
 
 
246 aa  44.7  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>