44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2006 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2006  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 		 240 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01930  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  56.9 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.472382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1838  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  52.16 
 
 		 262 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.999311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0763  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.13 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  42.24 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2720  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.59 
 
 		 267 aa  166  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0840  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.09 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.351261 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1302  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.17 
 
 		 250 aa  151  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0854069 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1375  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.58 
 
 		 294 aa  150  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0101  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.32 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.937724  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.91 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1353  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.41 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1420  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.93 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.437364 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.75 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.737915  normal  0.562517 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0498  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.8 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1007  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.36 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.02 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971287  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2980  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.42 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1123  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.67 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1082  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.16 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4088  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.85 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3313  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.03 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0716599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1179  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.62 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1321  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.62 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0781172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1896  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.72 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.665904  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3269  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.09 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2140  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.57 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.818693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13100  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  31.52 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0372  hypothetical protein  31.37 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1062  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.849255  normal  0.0474843 
 
 
-
 
NC_002950  PG1854  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  24.42 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3189  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.52 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32680  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  29.41 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.607571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0910  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.35 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3499  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.38 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000370866  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4180  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.68 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.241428  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1222  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.24 
 
 		 182 aa  42.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3471  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.83 
 
 		 186 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0875486  normal  0.451491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2279  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.44 
 
 		 198 aa  42  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1412  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.74 
 
 		 174 aa  42  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2443  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.14 
 
 		 199 aa  42  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0477  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like  26.44 
 
 		 238 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000127258  hitchhiker  0.0000923392 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1320  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  42.11 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4834  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.56 
 
 		 202 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>