38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1673 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 
233 aa  460  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0763  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  65.85 
 
 
262 aa  294  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2720  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  62.3 
 
 
267 aa  283  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1375  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  51.89 
 
 
294 aa  261  6e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.3 
 
 
241 aa  187  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1007  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  48.91 
 
 
237 aa  184  9e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1302  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  44.4 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0854069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1838  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  46.12 
 
 
262 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.999311  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  42.13 
 
 
243 aa  177  9e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.737915  normal  0.562517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2006  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  42.24 
 
 
240 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1420  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.85 
 
 
243 aa  175  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.437364 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1353  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.68 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0498  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  42.04 
 
 
245 aa  171  6.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0840  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  38.86 
 
 
235 aa  169  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.351261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01930  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  44.59 
 
 
241 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.472382 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0101  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.68 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.937724  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2980  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.04 
 
 
245 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.91 
 
 
246 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971287  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1123  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.51 
 
 
186 aa  88.6  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1082  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.95 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4088  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.48 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3313  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.08 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0716599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32680  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  34.48 
 
 
223 aa  48.5  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.607571  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1136  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  32.85 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13100  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  35.29 
 
 
221 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1246  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.47 
 
 
212 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1099  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.33 
 
 
185 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000408688  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1896  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.33 
 
 
201 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.665904  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1179  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.77 
 
 
189 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00819244  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3690  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.88 
 
 
208 aa  45.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0480146  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32823  predicted protein  38.96 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4834  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.03 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0711  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.49 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0477  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like  26.54 
 
 
238 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000127258  hitchhiker  0.0000923392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3669  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.82 
 
 
193 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.110558 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1674  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.12 
 
 
246 aa  41.6  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1329  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  25.74 
 
 
207 aa  42  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1321  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.47 
 
 
196 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0781172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>