87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1329 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1329  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1397  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  48.78 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1310  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  47.57 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.598341  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0501  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  48.44 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.893767  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1342  hypothetical protein  46.45 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.277285  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1213  conserved hypothetical protein, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family  41.09 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0883  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.43 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0845  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  38.15 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0711  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.02 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1253  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.32 
 
 		 177 aa  52.8  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1179  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  22.11 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3499  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.66 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000370866  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3338  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  22.95 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1682  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.83 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1118  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.06 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.424364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3313  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.53 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0716599  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32823  predicted protein  21.89 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1025  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.39 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.780063  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5032  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.57 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1062  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.85 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.849255  normal  0.0474843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1222  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.12 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5028  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  22.56 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0089  hypothetical protein  22.29 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0079  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.07 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.963155  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3528  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.41 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.92991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2983  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  22.16 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0256  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  22.16 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2109  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  22.16 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1854  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  25.93 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0268  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  22.16 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.533551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3365  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  22.16 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3661  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  21.35 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4946  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.44 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3313  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  22.16 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0452  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  22.16 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1295  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  22.64 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1321  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.08 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0781172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1260  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.41 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000254725  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3471  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.76 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0875486  normal  0.451491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0687  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.22 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0724  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  24.62 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1716  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.49 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.603023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2724  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  25.39 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.369069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0115  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.97 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0320458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1903  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.212625 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1320  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.67 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0967  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  21.62 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00139952  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3669  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.71 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.110558 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0541  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  35.06 
 
 		 173 aa  45.4  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0290502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4180  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.19 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.241428  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2351  putative ligase  23.4 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000100293  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0818  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.71 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.580242  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4275  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  25.34 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0203363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0874  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.05 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0779  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  22.37 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3517  hypothetical protein  40.43 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000273228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1334  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.36 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0492  5-formyltetrahydrofolate cyclo- ligase  34.72 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.776453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2140  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.67 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.818693 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1181  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  25.86 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4834  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.7 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1879  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  21.88 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0129  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  30.11 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000088129  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2040  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.11 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1246  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.53 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2731  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  25.81 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0115  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  22.29 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5362  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  24.53 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0924167  hitchhiker  0.0099602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0218  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  22 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2902  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  19.89 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1136  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  21.93 
 
 		 187 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2164  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.35 
 
 		 182 aa  42  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  25.74 
 
 		 233 aa  42  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1395  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  25 
 
 		 200 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4863  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  20.44 
 
 		 203 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0232  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  20.99 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11010  hypothetical protein  26.09 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.765426 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3767  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.68 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.08 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440361  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0467  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.72 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0111442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3509  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.97 
 
 		 193 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.170426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0899  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, putative  40 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02470  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00344803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0694  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.38 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4377  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.45 
 
 		 197 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.710446  normal  0.650107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4291  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.45 
 
 		 197 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2769  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.79 
 
 		 200 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00685843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>