27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1882 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 
243 aa  490  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.737915  normal  0.562517 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1420  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  84.77 
 
 
243 aa  438  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.437364 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0840  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  79.22 
 
 
235 aa  390  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.351261 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1302  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  75.31 
 
 
250 aa  361  6e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0854069 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1353  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  64.29 
 
 
243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  52.14 
 
 
241 aa  236  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0498  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  50.21 
 
 
245 aa  217  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1007  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  50.22 
 
 
237 aa  188  5e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  42.13 
 
 
233 aa  171  7.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0763  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.6 
 
 
262 aa  169  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2720  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  38.87 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1375  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.02 
 
 
294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0101  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.21 
 
 
243 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.937724  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01930  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.25 
 
 
241 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.472382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1838  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  40.08 
 
 
262 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.999311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2006  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.75 
 
 
240 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.02 
 
 
246 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971287  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2980  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.19 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1082  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35 
 
 
186 aa  95.5  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1123  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.18 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0477  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like  25.23 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000127258  hitchhiker  0.0000923392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1179  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.39 
 
 
189 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00819244  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4088  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  38 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1099  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.57 
 
 
185 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000408688  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32823  predicted protein  29.81 
 
 
222 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194414  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23890  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  33.02 
 
 
198 aa  42  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3690  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.7 
 
 
208 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0480146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>