47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01930 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01930  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 		 241 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.472382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1838  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  67.24 
 
 		 262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.999311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2006  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  56.9 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0763  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  44.03 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1302  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  43.83 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0854069 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1420  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.25 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.437364 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1353  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.68 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0840  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  42.36 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.351261 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2720  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.77 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.25 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.737915  normal  0.562517 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  44.59 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.5 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0498  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  38.3 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1375  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.37 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0101  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.62 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.937724  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1007  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  43.97 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.5 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971287  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2980  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.78 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1123  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.32 
 
 		 186 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1082  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.66 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3313  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.38 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0716599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4088  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.76 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0477  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like  31.19 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000127258  hitchhiker  0.0000923392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1179  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.49 
 
 		 189 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3294  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.87 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0860  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.92 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00252487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0857  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  27.92 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000142389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0967  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.42 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00139952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1099  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.66 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000408688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3824  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  27.92 
 
 		 198 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1674  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  29.7 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0904  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.91 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2443  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.06 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1412  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.33 
 
 		 174 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0910  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.91 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1682  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.9 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2384  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.44 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3189  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  30.7 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23890  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  30.68 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03206  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0711  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  23.81 
 
 		 202 aa  42.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1025  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.32 
 
 		 196 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.780063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1896  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.4 
 
 		 201 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.665904  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1246  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.65 
 
 		 212 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188109  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5362  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.98 
 
 		 205 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0924167  hitchhiker  0.0099602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32680  5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase  34.72 
 
 		 223 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.607571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2140  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  37.66 
 
 		 202 aa  42  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.818693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>