37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0101 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0101  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.937724  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1435  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  42.98 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1007  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  41.38 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0840  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.84 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.351261 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1302  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.66 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0854069 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1420  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.36 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.437364 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1882  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.21 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.737915  normal  0.562517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2006  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.32 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0498  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.82 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1353  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.89 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0763  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.08 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1673  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.68 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2720  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.85 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01930  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.33 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.472382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1838  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.89 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.999311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1375  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.34 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2980  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.2 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2976  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.38 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971287  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1082  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.47 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1123  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.02 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0477  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like  31.2 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000127258  hitchhiker  0.0000923392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3690  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.8 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0480146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4088  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.56 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1246  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.53 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1295  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.57 
 
 		 191 aa  45.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1879  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.05 
 
 		 188 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3313  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  28.09 
 
 		 195 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0716599  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1682  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.07 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2726  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family protein  33.33 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3499  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.33 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000370866  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1674  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  35.8 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1099  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.08 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000408688  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6323  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.78 
 
 		 178 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.214441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03206  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  31.33 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20586  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1761  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  33.33 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1179  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  27.06 
 
 		 189 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0967  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.1 
 
 		 191 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00139952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>