More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4017 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4017  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 321 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535278  normal  0.0175601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  47.27 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  38.31 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  39.62 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  38.89 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  38.78 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  38.34 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  40.13 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  38.34 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  36.54 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  38.34 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  39.4 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  43.73 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  41.83 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  40 
 
 		 304 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.38 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  37.99 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.76 
 
 		 346 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  38.94 
 
 		 372 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  39.07 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  42.48 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  38.06 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2922  cysteine synthase A  37.74 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  38.85 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.91 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  38.61 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.54 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  40 
 
 		 317 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  36.25 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  39.87 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  36.25 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  37.82 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  41.2 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5540  cysteine synthase  37.7 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816879  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5905  cysteine synthase  37.7 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  41.2 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2304  cysteine synthase  37.62 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  36.75 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  38.54 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  39.94 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.62 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.816329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.22 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.53 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1605  O-acetylserine (thiol)-lyase  35.99 
 
 		 343 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  38.22 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  33.54 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  38.56 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  37.42 
 
 		 345 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  35.6 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  39.61 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  39.51 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  35.76 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  35.76 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  39.02 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  38.61 
 
 		 305 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  38.54 
 
 		 304 aa  170  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6411  cysteine synthase  36.72 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  39.87 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  35.14 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1489  cysteine synthase A  39.54 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.926588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  36.48 
 
 		 463 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  37.66 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  39.02 
 
 		 324 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0343  cysteine synthase A  37.54 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  36.07 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.9 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4677  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.5 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  39.38 
 
 		 764 aa  168  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1363  cysteine synthase A  36.91 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  41.58 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  34.75 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  38.23 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  37.7 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  35.35 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  37.66 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.6 
 
 		 453 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  35.35 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  33.44 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  37.95 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  38.61 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  35.88 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  36.25 
 
 		 332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  39.56 
 
 		 320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  34.73 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  35.24 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  36.77 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  39.53 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  35.2 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  36.77 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  37.05 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  38.76 
 
 		 320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  40.13 
 
 		 306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1337  cysteine synthase A  42.57 
 
 		 310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241539  normal  0.869018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.66 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  38.91 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  37.32 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  37.58 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  35.69 
 
 		 459 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  39 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  41.12 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>