More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5540 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5540  cysteine synthase  100 
 
 
312 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816879  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5905  cysteine synthase  100 
 
 
312 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6411  cysteine synthase  98.72 
 
 
312 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1265  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.28 
 
 
336 aa  246  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  44.15 
 
 
312 aa  235  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  43.48 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.72 
 
 
319 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  44.44 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  43.19 
 
 
307 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  41.86 
 
 
307 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  38.74 
 
 
310 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  38.74 
 
 
310 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  38.87 
 
 
310 aa  211  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  42.24 
 
 
323 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  42.76 
 
 
320 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  37.95 
 
 
461 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  41.97 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  39.26 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  39.13 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  42.9 
 
 
320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  39.13 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  40.32 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  39.13 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  39.13 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  39.13 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  39.13 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  39.13 
 
 
303 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  39.34 
 
 
331 aa  199  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  38.74 
 
 
303 aa  198  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  39.87 
 
 
307 aa  198  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  39.26 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  39.13 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  40.2 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  40.95 
 
 
454 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  39.26 
 
 
303 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  41.75 
 
 
309 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  39.26 
 
 
303 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  38.87 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  43.38 
 
 
310 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  42.38 
 
 
306 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  41.45 
 
 
309 aa  195  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  38.71 
 
 
352 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  40.68 
 
 
291 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  37.89 
 
 
349 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.2 
 
 
343 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  39.87 
 
 
307 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  38.64 
 
 
307 aa  193  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  38.41 
 
 
303 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  38.61 
 
 
311 aa  192  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  40.67 
 
 
308 aa  192  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3608  cysteine synthase  44.04 
 
 
324 aa  192  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0650049  hitchhiker  0.00838778 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  37.54 
 
 
300 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  39.14 
 
 
310 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  39.02 
 
 
311 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  39.66 
 
 
290 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  41.67 
 
 
308 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  39.34 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  37.54 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  37.87 
 
 
304 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  41.69 
 
 
308 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  42.24 
 
 
314 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  37.12 
 
 
315 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1657  cysteine synthase A  42.23 
 
 
322 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1424  cysteine synthase A  37.25 
 
 
346 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.81 
 
 
453 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  41.25 
 
 
320 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2140  cysteine synthase A  38.89 
 
 
342 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  41.37 
 
 
308 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  39.14 
 
 
308 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  37.22 
 
 
459 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  38.59 
 
 
295 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  37.16 
 
 
292 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.54 
 
 
459 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  38.06 
 
 
344 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  36.96 
 
 
349 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  37.16 
 
 
292 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  39.46 
 
 
302 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  40.33 
 
 
309 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  38.13 
 
 
305 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.02 
 
 
343 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  37.54 
 
 
324 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  37.16 
 
 
292 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  36.96 
 
 
349 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  40.85 
 
 
309 aa  185  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  36.45 
 
 
306 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1493  cysteine synthase A  39.42 
 
 
333 aa  185  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.464198 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.22 
 
 
459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  40.46 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  39.14 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  38.19 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.56 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2067  cysteine synthase A  38.06 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  39.74 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  42.55 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  39.33 
 
 
305 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  36.6 
 
 
332 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.01 
 
 
459 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  39.4 
 
 
311 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  39.2 
 
 
307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  37.79 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>