More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3224 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3224  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.774364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2570  3-dehydroquinate dehydratase  76.6 
 
 		 151 aa  238  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 149 aa  156  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 152 aa  156  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 193 aa  150  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 146 aa  147  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 148 aa  146  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 147 aa  146  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 		 150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 193 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 193 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 193 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.92 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.97 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.29 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 176 aa  135  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 160 aa  135  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 		 148 aa  133  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  44.44 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  46.72 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  44.12 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 153 aa  126  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.83 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.26 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 		 156 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  42.86 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  43.26 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  39.73 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  39.73 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 		 179 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  46.1 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  43.66 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  41.67 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  39.04 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  43.48 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  49.25 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  39.07 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>