More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3678 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3678  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
240 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.49092  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1887  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.74 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1711  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.81 
 
 
242 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.67 
 
 
271 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000193962  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.17 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17620  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.17 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10923  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 
243 aa  92  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269045  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2484  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.86 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.585223  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
259 aa  89.7  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 
259 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4812  enoyl-CoA hydratase  35.33 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365377  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.82 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4431  enoyl-CoA hydratase  35.33 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4518  enoyl-CoA hydratase  35.33 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4992  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
246 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388804  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.73 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.14 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  34.44 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  35.68 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  35.44 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  35.64 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  34.44 
 
 
258 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
263 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
263 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5948  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495615  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  32.51 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.51 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1755  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  31.74 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.51 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  34.05 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.56 
 
 
661 aa  79.3  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  79  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
290 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
290 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.45 
 
 
251 aa  79  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.83 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
258 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.253569  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2878  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.51 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  32.87 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.05 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  37.14 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  31.96 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.53 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65674  normal  0.797178 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04036  hypothetical protein  30.05 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.13651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4679  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.05 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4452  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.05 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4769  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.05 
 
 
258 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4743  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.05 
 
 
258 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0219065  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0474  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  37.14 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
258 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09128  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01210)  34.88 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04074  conserved hypothetical protein  30.05 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.69 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.05 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.15 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  33.51 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5085  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.57 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.69 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  29.69 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.19 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.45 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  32.75 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.14 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  30.48 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.22 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0067  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  29.89 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.52 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1374  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.548456  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  31.79 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  36.31 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.107177  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3990  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>