More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1887 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1887  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
248 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.99 
 
 
271 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000193962  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1711  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.64 
 
 
242 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3678  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.49092  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.16 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.74 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.91 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 
263 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.39 
 
 
692 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.82 
 
 
659 aa  85.9  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4812  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
244 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365377  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4431  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
244 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  34.67 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4518  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
244 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.9 
 
 
269 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1755  enoyl-CoA hydratase  35.84 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1868  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.22 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.59 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0474  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.33 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.42 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.22 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.86 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0067  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.91 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.63 
 
 
266 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  28.14 
 
 
260 aa  82  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  29.81 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.78 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.48 
 
 
661 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.38 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.9 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.07 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  28.16 
 
 
662 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.93 
 
 
249 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.253569  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.94 
 
 
258 aa  79  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2845  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418648  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.12 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  33.52 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.71 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  26.42 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.67 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.52 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.419854  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6335  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.08 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10923  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269045  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  29.55 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4992  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388804  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49128  predicted protein  28.57 
 
 
722 aa  76.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.769408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3363  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.55 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.42 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2998  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.172994  normal  0.145485 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  32.12 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.32 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.65 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5085  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.74 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  28.69 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  32.38 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17620  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.91 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.74 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.71 
 
 
663 aa  75.5  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3275  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.65 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  25.86 
 
 
662 aa  75.1  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  28.98 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  31.28 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.17 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1546  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.53 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.53 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14230  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.41 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0814417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.21 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.94 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  31.66 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.42 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.9 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>