More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1711 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1711  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
242 aa  474  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1887  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.64 
 
 
248 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.32 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000193962  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3678  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.93 
 
 
240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.49092  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
280 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
261 aa  88.6  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  35.67 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1159  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.609524 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.65 
 
 
661 aa  85.1  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.44 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  33.52 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  34.67 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0173  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.31 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00691554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.61 
 
 
273 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2377  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  28.42 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  32.78 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.61 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.12 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.45 
 
 
662 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  30.3 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.32 
 
 
662 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  30.88 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
260 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 
260 aa  79  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
273 aa  78.6  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.67 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4518  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4812  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365377  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  35.33 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4431  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.9 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5948  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.63 
 
 
253 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495615  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2845  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418648  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.94 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.59 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.76 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  31.38 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.55 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  29.85 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.08 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  29.95 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17860  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.89 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213095  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  28.72 
 
 
662 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1929a  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.991387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  32.98 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4851  enoyl-CoA hydratase  32.63 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.54 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  31.38 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.05 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  29.56 
 
 
269 aa  75.1  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  32.62 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.9 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  33.14 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  33.14 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  29.67 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5636  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.96 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603741  decreased coverage  0.00134982 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17620  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.2 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5223  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.96 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136536  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0164  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.93 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.04 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.43 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.9 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.98 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5465  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.46 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1464  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.09 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.710715  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5085  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.19 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  32.86 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.5 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  29.49 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.55 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  29.49 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1546  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4916  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.46 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>