More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8362 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8362  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 453 aa  905    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  79.91 
 
 		 445 aa  695    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 416 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  27.92 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 420 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  29.5 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 406 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  29.1 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 399 aa  127  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 447 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  28.73 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.73 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  28.73 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.73 
 
 		 408 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.73 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.73 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.73 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.86 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.86 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.86 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.86 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 429 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 404 aa  123  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  27.67 
 
 		 428 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 399 aa  123  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  27.67 
 
 		 432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  27.67 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  27.67 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  27.84 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28.57 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  28.16 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.94 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  28.75 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 433 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  28.34 
 
 		 427 aa  117  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  28.34 
 
 		 427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  27.4 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.72 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 420 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 440 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 445 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  28.61 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  28.61 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  28.61 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  26.8 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  27.72 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  27.09 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.08 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  26.99 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  27 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 425 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  26.81 
 
 		 456 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>