76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4464 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4464  PE-PGRS family protein  100 
 
 		 494 aa  915    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5728  PE-PGRS family protein  59.15 
 
 		 502 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  27.74 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  29.4 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  28.51 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  26.37 
 
 		 997 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  27.57 
 
 		 449 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  32.56 
 
 		 708 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.02 
 
 		 206 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  28.57 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  30.04 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  29.2 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  28.65 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.5 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  28.02 
 
 		 207 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  28.9 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.76 
 
 		 206 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  29.25 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  27.67 
 
 		 237 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  32.05 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.54 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  28.02 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  28.41 
 
 		 693 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.05 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  29.6 
 
 		 577 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  28.09 
 
 		 244 aa  56.6  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  26.91 
 
 		 237 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.18 
 
 		 225 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  28.16 
 
 		 571 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  31.67 
 
 		 274 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  30.06 
 
 		 207 aa  54.7  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  31.67 
 
 		 274 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  27.03 
 
 		 255 aa  53.5  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  46.38 
 
 		 211 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  34.05 
 
 		 285 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  34.05 
 
 		 285 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  30.98 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  29.33 
 
 		 692 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  44.93 
 
 		 211 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  26.18 
 
 		 242 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  33.58 
 
 		 212 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  26.47 
 
 		 239 aa  50.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  29.07 
 
 		 652 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  35.53 
 
 		 562 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  29.83 
 
 		 703 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.06 
 
 		 243 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  29.54 
 
 		 703 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  29.68 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  34.01 
 
 		 232 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  26.24 
 
 		 234 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.17 
 
 		 240 aa  47.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  29.02 
 
 		 662 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  37.5 
 
 		 570 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  28.66 
 
 		 237 aa  47.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  28.19 
 
 		 243 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  27.4 
 
 		 212 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  31.39 
 
 		 570 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  29.54 
 
 		 283 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1972  Carbohydrate-selective porin OprB  31.62 
 
 		 703 aa  47  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0983998 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  28.12 
 
 		 250 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  33.15 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  29.78 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  26 
 
 		 238 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  31.52 
 
 		 247 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  31.87 
 
 		 289 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  31.87 
 
 		 289 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.21 
 
 		 710 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  26.61 
 
 		 212 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  31.55 
 
 		 237 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  26.81 
 
 		 193 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  29.26 
 
 		 261 aa  43.9  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  31.25 
 
 		 243 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  29.24 
 
 		 279 aa  43.9  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  26.55 
 
 		 258 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  25.1 
 
 		 213 aa  43.5  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  30.34 
 
 		 276 aa  43.5  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>