59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5728 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5728  PE-PGRS family protein  100 
 
 		 502 aa  924    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4464  PE-PGRS family protein  58.82 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  28.86 
 
 		 997 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  27.73 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  31.06 
 
 		 237 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  35 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  28.3 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  25.93 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  26.14 
 
 		 453 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  31.37 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  28.57 
 
 		 693 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  27.95 
 
 		 207 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.95 
 
 		 207 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  34.93 
 
 		 204 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.87 
 
 		 206 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.64 
 
 		 206 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  30.53 
 
 		 237 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  29.73 
 
 		 225 aa  53.9  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  37.31 
 
 		 211 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  26.84 
 
 		 244 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  28.77 
 
 		 662 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  31.76 
 
 		 703 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  31.47 
 
 		 703 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  36.57 
 
 		 211 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  28.57 
 
 		 207 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  28.08 
 
 		 240 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  32.37 
 
 		 570 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.12 
 
 		 207 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.71 
 
 		 661 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  29.02 
 
 		 708 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  29.71 
 
 		 562 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  28.1 
 
 		 241 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  25.68 
 
 		 449 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  32.19 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  28.81 
 
 		 212 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  29.73 
 
 		 245 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  26.28 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  28.08 
 
 		 237 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  28.38 
 
 		 255 aa  47  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  27.43 
 
 		 206 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  27.27 
 
 		 243 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  31.25 
 
 		 216 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  32.72 
 
 		 598 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33.59 
 
 		 240 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  30.46 
 
 		 212 aa  46.6  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  28.02 
 
 		 213 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  26.72 
 
 		 198 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  28.86 
 
 		 209 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  26.74 
 
 		 236 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  27.57 
 
 		 246 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1972  Carbohydrate-selective porin OprB  28.02 
 
 		 703 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0983998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  28.11 
 
 		 254 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  27.08 
 
 		 571 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  33.97 
 
 		 239 aa  44.3  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  26.07 
 
 		 254 aa  44.3  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  30.46 
 
 		 212 aa  43.9  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  32.93 
 
 		 283 aa  43.9  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  31.14 
 
 		 570 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  34.31 
 
 		 207 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>