101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1493 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  100 
 
 		 169 aa  336  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  93.49 
 
 		 169 aa  317  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  72.78 
 
 		 169 aa  258  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  72.78 
 
 		 169 aa  258  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  71.6 
 
 		 169 aa  255  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  72.19 
 
 		 169 aa  254  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  51.22 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  47.56 
 
 		 164 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  47.88 
 
 		 170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  47.27 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  50.6 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  46.31 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  39.07 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  35.44 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  37.67 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  34.62 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  33.77 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  33.77 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  33.77 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  33.77 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  33.77 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  36.3 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  34.67 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  31.61 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  31.82 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  34.67 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  31.51 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  32.26 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  32.5 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  33.56 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  29.8 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  30.14 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  29.53 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  29.8 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  29.8 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  35.64 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  35.64 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  30.71 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  33.98 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2857  hypothetical protein  30.15 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  28.67 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  28.57 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  28.99 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  26.85 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  28.76 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  29.79 
 
 		 247 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  32.32 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  26.43 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  28 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  29.29 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  28.95 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  34.85 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3344  protein of unknown function DUF892  29.51 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0480671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  27.74 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  27.21 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  29.03 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  26.06 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  32.08 
 
 		 198 aa  44.3  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  27.22 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  31.87 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  28.38 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4247  protein of unknown function DUF892  27.74 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  28.38 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  33.02 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2862  protein of unknown function DUF892  29.29 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.217094  normal  0.674493 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2282  protein of unknown function DUF892  27.39 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  24.49 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  29.79 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  26.62 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  26.62 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  26.62 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  29.61 
 
 		 167 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  26.62 
 
 		 167 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  26.62 
 
 		 167 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  25.9 
 
 		 180 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  27.56 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  27.56 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  27.56 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  27.56 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  27.56 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  27.56 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  27.56 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0111142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  25.36 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  27.56 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  24.65 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  26.28 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  26.85 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5546  hypothetical protein  25.49 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376366  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2297  hypothetical protein  29.1 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  29.08 
 
 		 175 aa  40.8  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  26.09 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  27.97 
 
 		 217 aa  40.8  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>